在血浆和宿主细胞膜上存在一些负向调控蛋白，保护健康宿主细胞免受其表面补体异常激活导致的损伤效应。这些补体调控蛋白与C3b 相互作用，或阻止转换酶的形成，或加速其解离。
血浆蛋白酶 I 因子与作为辅助因子的C3b结合蛋白，如另一种宿主细胞膜蛋白——蛋白水解膜辅助因子（ membrane cofactor of proteolysis, MCP 或CD46）共同作用，可将 C3b切割成无活性的衍生物iC3b，最终阻止转换酶的形成。
CR1 与C3b或C4b结合，可抑制经典或旁路途径C3转化酶形成，还可作为I因子的辅助因子，促进C3b或C4b 裂解；
H因子也可作为I因子的辅助因子发挥作用。